Colný úrad neprepustí tovar do navrhnutého režimu, ak:

- colný dlh , ktorý vznikne prijatím písomného colného vyhlásenia, nie je splnený alebo zabezpečený, s výnimkou režimu dočasné použitie s čiastočným oslobodením od dovozných platieb
- colný dlh, ktorého zabezpečenia colný úrad požaduje, nie je zabezpečený alebo
- má pochybnosti o tom, či sa na dovážaný tovar nevzťahujú zákazy a obmedzenia, a tieto pochybnosti nemôžu byť odstránené skôr ako budú známe výsledky ním vykonanej kontroly.

Colný zákon umožňuje aj colné vyhlásenie pri zjednodušenom postupe , čo sa aplikuje najmä pre:
- zjednodušený postup pre režim voľný obeh
- pre režim vývoz
- colné vyhlásenie pre režimy s ekonomickým účinkom

Colný zákon upravuje aj postup colného úradu pri preverovaní colného vyhlásenia, keď colný úrad môže z vlastného podnetu alebo na žiadosť deklaranta preveriť písomné colné vyhlásenie po prepustení tovaru- môže kontrolovať obchodné doklady a údaje vzťahujúce sa na dovozné alebo vývozné operácie súvisiace s príslušným tovarom alebo vzťahujúce sa následné obchodné operácie s týmto tovarom.
-colný úrad je oprávnený prehliadať aj tovar, ak je to ešte fyzicky možné.